Ситуация: При исследовании архивов базы (квест "Архивы компьютера базы"), если есть грузовой корабль, точка базы (на стадии квестовой активации она красного цвета) в момент определённого квестового шага перемещается на грузовой корабль в космосе и её никак не активировать.

Решение: Смотрим, чтобы мы были в той системе, которая нужна для квеста (это описано в квесте или подойдите к телепорту на станции и посмотрите куда надо лететь). Если в этой системе нет базы - строим её (хотя бы на базовом уровне просто занимаем место под базу в любом месте какой-нибудь планеты). В той системе, где нужно делать квест базы, перелетаем уже на другую планету (где нет нашей базы) и высаживаемся из корабля. Телепортируем над собой грузовой корабль (быстрое меню) и видим, что точка активации квеста не привязана к грузовому кораблю и осталась в космосе, на бывшем месте грузового корабля. Теперь возвращаемся на свою оригинальную базу и видим, что точка опустилась из космоса к базе. Выполняем нормально квест дальше.

Экспериментально проверил с множеством баз: если точка появляется на грузовом корабле, то корабль нужно "призвать" куда-нибудь на другую планету, где нет базы. Тогда после телепорта на базу с квестом всегда работает всё хорошо. Проблема просто в грузовом корабле.